La metanfetamina tiene dos isómeros, d-metanfetamina (dextrometanfetamina) y l-metanfetamina (levometanfetamina). La d-metanfetamina se fabrica con mayor frecuencia de forma ilícita y se considera una droga de abuso (metanfetamina, etc.). Está aprobado como tratamiento para el TDAH y la obesidad, aunque su uso es muy limitado. La l-metanfetamina se usa en ciertos inhaladores de venta libre como descongestionante. Esta prueba es un ensayo definitivo que utiliza un método de análisis de espectroscopía de masas por cromatografía de gases (GC-MS). En las pruebas de confirmación de rutina de anfetaminas, los isómeros específicos de la metanfetamina no se diferencian y se informan como "Metanfetamina". En situaciones en las que este sea un resultado inesperado, puede resultar útil determinar los porcentajes relativos de cada isómero presente. La presencia del isómero L en más del 80% es consistente con el uso de inhaladores sin receta. La presencia del isómero D superior al 20% es consistente con el uso de medicamentos recetados o metanfetamina fabricada ilegalmente. No se pueden utilizar valores cuantitativos para evaluar la dosis del fármaco, porque el fármaco se metaboliza ampliamente y se excreta en la orina.
Ayuno de 8 a 12 horas antes del examen. No ingerir medicamentos inmunosupresores 48 horas antes del estudio, a menos que el médico indique lo contrario.